Les maladies auto-immunes et inflammatoires systémiques (MS) constituent un ensemble hétérogène d’affections. Les complications infectieuses restent une source importante de morbimortalité. Il apparaît que les infections représentent un des motifsprincipaux d’admission en réanimation et une des sourcesprincipales de décès. Le rapport bénéfice/risque des corticoïdes, des immunosuppresseurs  et des biothérapies doit toujours être pris en compte avant la mise en route d’un traitement. Des mesures préventives simples comme la vaccination antipneumococcique et la prescription de cotrimoxazole en prophylaxie doivent être envisagées dès lors qu’une corticothérapie au long cours associée ou non à un traitement immunosuppresseur est envisagée. La survenue d’une fièvre chez un patient atteint d’une MS peut être liée à une poussée de la maladie de fond mais la règle est de considérer qu’il s’agit d’une infection jusqu’à preuve du contraire.